El marco normativo del ISEP supone el objetivo de fortalecer el vínculo con los Institutos de Formación Docente (IFD) existentes a fin de hacer posible un dispositivo pedagógico que garantice el desarrollo profesional docente en la provincia.
Bajo ese punto de partida, la gestión e implementación de los trayectos de formación del Instituto se llevan a cabo a partir de la articulación con una serie de IFD Asociados al ISEP, espacios desde donde se concretan cada una de las propuestas académicas, garantizando que la calidad y la gratuidad de la oferta estatal se haga extensiva en todo el territorio provincial.
En la actualidad el ISEP cuenta con 11 Institutos de Formación Docente Asociados desde donde se concreta el dictado de cada una de las carreras.